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从96孔微培养板生长的哺乳动物细胞中分离DNA

发布时间 2010-01-17 浏览量 作者: 无 来源: 生物无忧

材料:
缓冲液和溶液:
细胞裂解缓冲液:
    10 mmol/L Tris-Cl (ph7.5)
    10mmol/L NaCl
    0.5%(m/v)Sarkosyl
    乙醇
    NaCl/乙醇溶液
磷酸盐缓冲液(PBS):
    蔗糖盐缓冲液
    TE(PH8.0)
酶和缓冲液:
    限制性内切核酸酶
    无Dnase的Rnase
专用设备:
    与带阀门的真空管相连的抽泣设备
    多通道移液器, 8或12道
    温箱,预设至60 ℃ .
    振摇平台
    Tupperware容器
细胞核组织:
    在96孔微培养板上生长的细胞

方法:

1、用蓝色尖头或者巴斯特移液管吸取96孔培养板每个培养孔中的培养液.
2、每个培养孔中的细胞用100ul磷酸盐缓冲液冲洗2次.
3、用多通道移液器在微培养板的每个孔中加入50ul细胞裂解液.将数张湿的吸水纸置入一个聚丙烯盒中(如Tupperware盒),再将盛有细胞裂解液和西部微培养板放在吸水纸上,用盖封严盒子.
4、将封好的盒子在60 ℃温箱中温育12-16h.
5、将叶子移出温箱,取出培养板平放在工作台上,冷却数分钟,每孔加入100ul NaCl/乙醇溶液.不用混匀,直接将培养板于室温温育30min.温育末期硬件到纤维状的核酸沉淀.
6、缓慢地倒转培养板,将乙醇溶液倒入水池.核酸沉淀应黏附在培养孔的底部,将每个培养板倒置于干燥的吸水纸上,使残余乙醇从培养板流出.
7、每孔加入150ul 70%乙醇,小心不要移动核酸沉淀.按步骤6倒转培养板以去除70%乙醇.在吸水纸吸取多余的液体.用70%乙醇再冲洗沉淀2次.
8、使培养板在室温干燥直至最后的乙醇挥发.如果基因组DNA将用于PCR分析,进行步骤9. 如果DNA将用于Southern杂交,进行步骤10.11和12 .
9、每孔加入30-50ul TE(ph8.0),室温缓和地振摇12-16h使DNA溶解.
10、如果DNA将用于Southern杂交,制备下列限制性内切核酸酶混合物;每孔需40ul.
    H2O 0.8 倍体积
    10* 限制性内切核酸酶 0.1 倍体积
    无 Dnase 的 Rnase 10ug/ml
    使用前每40ul混合物加入10个单位限制性内切核酸酶.
11、用多通道移液器在每个孔中加入 40ul 限制性内切核酸酶反应混合物.反复抽吸数次使孔中内容物混合,小心避免气泡.按步骤3用Tupperware容器制作湿盒,将培养板放入,使反应在适宜的消化温度温育12-16h.
12、加入5-10ul蔗糖凝胶上样缓冲液终止反应,按方案8、9、10描述的方法进行Southern印迹和杂交以分析消化的DNA.

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