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关于WB的小知识

发布时间 2009-07-24 浏览量 作者: 无 来源: 生物无忧

一、考马斯亮蓝G250与R250的区别
    R250中的R代表Red,偏红,属于慢染,脱色脱的完全,主要用于电泳染色
    R250(Coomassie brilliant blue R250).C45H44O7H3S2Na,MW=824,
    λmax=560―590nm.染色灵敏度比氨基黑高5倍.尤其适用于SDS电泳微量蛋白质染色.但蛋白质浓度超出一定范围时,对高浓度蛋白的染色不符合Beer定律,用作定量分析时要注意这点.
    G250中的G就是Green,偏绿,属于快染,脱色脱的不彻底,主要用于蛋白测定
    又名Xylene brilliant cyaninG.比考马斯亮蓝R250多二个甲基.MW=854;λmax=590―610nm.染色灵敏度不如R250,但比氨基黑高3倍.优点在于它在三氯乙酸中不溶而成胶体,能选择地染色蛋白而几乎无本底色.所以常用于需要重复性好和稳定的染色,适于作定量分析.
    简单一句话:G250主要用于蛋白测定;R250主要用于电泳染色
二、做WB实验时各种培养器皿要加多少裂解液
    六孔板的一个孔加入100微升的裂解液为标准,根据面积来换算其他培养器皿所要加入裂解液的量.只做参考!
三、显影液的存放
    配制好的显影液是避光放置的(相信大家知道这点),而且配制好的显影液是不能和空气接触的,否则会很快发黄.我一般是一次配制1升的显影液,然后平均分为4份.把不用的3份装到容量小于250ml的棕色瓶中(盖盖子时刚好有多余的显影液溢出),封口胶封好再放置阴暗处.
四、NP-40 ,TritonX-100,SDS三种去垢剂的裂解能力的对比
    这三种去垢剂的作用是不同的,或者说作用力量强弱不同.SDS属于离子型去垢剂,最厉害,基本可以把细胞完全破掉,DNA会释放出来,裂解液变得很粘稠.NP-40是很温和的去垢剂,1%浓度的基本可以破坏掉胞膜,而对核膜破坏的作用弱,结合特定的buffer可以获得胞浆蛋白.TritonX-100的能力介于NP40和SDS之间,偏向于NP40,也是常用的细胞裂解液成分之一,在保护蛋白活性方面有一定作用(SDS基本会使蛋白变性失活).


五、边缘孔效应
    跑PAGE电泳时,凝胶两边的孔道是不建议使用的,因为很多时候凝胶两边的孔道在凝聚的时候都会不均匀凝聚,导致电泳条带弯曲.
六、显影液
    好的,敏感的显影液能把十分微弱的目的条带显示出来.
七、抗体的孵育浓度
    不要相信抗体说明书上的稀释比例,1:1000稀释浓度是个好的开始!
八、小分子蛋白的电泳
    对于小于10KDa的蛋白质使用Tricine–SDS-PAGE方法进行电泳会更容易出结果
九、大分子与小分子蛋白的转膜
    大分子蛋白质(>100KDa)
    1.大分子蛋白跑的十分的慢,所以要确定分离胶的浓度不要大于8%,同时转膜的时间还要适当的延长;
    2.大分子蛋白质很容易在凝胶里沉淀,阻碍转移.在转膜缓冲液中加入SDS可以阻止大分子蛋白质沉淀,但甲醇会把SDS从蛋白质中脱离下来,所以降低转膜缓冲液中甲醇的含量有利于大分子蛋白质的转膜;
    小分子蛋白质(<100KDa)
    1.SDS会阻碍所有的蛋白质结合到膜上,而小分子蛋白质所受到的影响会比大分子蛋白质大,所以如果目的蛋白的分子量比较小的话,要考虑把SDS从转膜缓冲液中移除;
    2.保持转膜缓冲液中甲醇的浓度在20%左右.


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