1、用 1xTAE 电泳缓冲液灌制一块含有适当浓度的低熔点琼脂糖凝胶.
    所以选择TAE 而非TBE 有几个理由.主要是 TBE 中的硼酸盐离子能抑制连接反应,并能干扰从玻璃珠上洗脱下来的DNA 片段的纯化.
    溴化乙锭可在凝胶灌制前加入,终浓度为 0.5ug/ml ,也可在电泳结束后,用溴化乙锭或SYBR Gold 染色液进行染色.
2、待凝胶冷却至室温后,将凝胶连同支撑用的玻璃板一起移至胶盒的水平表面上.凝胶也可以放在冷室以保证凝胶充分凝固.
3、将 DNA 样品与载样缓冲液混合,注入到加样孔中,以 3-6V/cm 的电压进行电泳.
    特定分子质量大小的DNA 在低熔点琼脂糖凝胶中的泳动速度快于常规琼脂糖凝胶,正因为如此,低熔点琼脂糖所加电压应低于常规琼脂糖凝胶.
4、如需要,可用溴化乙锭或 SYBR Gold 染色液进行染色.用手提式长波 (302nm) 紫外灯确定所需条带的确切位置.
5、用一锋利的刀片或剃刀切下含目的条带的琼脂糖凝胶切片,转移至一个干净的一次性使用的塑料管里.
6、切下条带后,进行拍照,从而获得切出条带的记录.
7、加约5 倍体积的LMT 洗脱缓冲液至琼脂糖切片中.盖好管盖,于65 ℃ 温育5 min 熔化凝胶.
8、待凝胶冷却至室温后,加等体积的平衡酚,将混合液混旋 20s . (Sorvall SS-34 转子 5800r/min) 离心 10min ,回收水相.
    界面的白色物质即是琼脂糖.
9、再用等体积的酚：氯仿、氯仿各抽提1次.
10、水相转移至另一新的离心管中.加 0.2 倍体积的10mol/L 乙酸铵和2倍体积4 ℃的无水乙醇.混合液在室温下放置10min .然后4 ℃ , 5000g (Sorvall SS-34 转子相当于 6500r/min) 离心20 min ,沉淀回收DNA .
11、用70 ％乙醇清洗沉淀,并溶于适当体积的TE(pH8 . 0) 中. 

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